المسجد الوطنى يقع في وسط العاصمة كوالالمبور بالقرب من حدائق بردانا، ويحتل المسجد مساحة 5 هكتار تقريبا وهو قريب جداً من محطة قطار كوالالمبور القديمة التى تعد معلما أثريا هاما فى ماليزيا، كما يزين المسجد من الخارج بالنافورات والأحواض ويعتبر هذا المسجد صورة واضحة من حيث التصميم الاسلامى الحديث فى ماليزيا والذى يشمل على فن كتابة الخط اليدوى التقليدى وكذلك الزخارف، وأكثر ما يلفت انتباه الزوار لهذا المسجد هو منارته ذات التصميم المشابه للمظلة الشمسية والتى يبلغ ارتفاعها 245 مترا .

 ويوجد بالمسجد أماكن خاصة للنساء ، وفيه قاعات مخصصة لتدريس اللغة العربية و العلوم الشرعية وتحفيظ القرآن.